防御で物理攻撃を完封できてしまうことが問題だというのには同意します。
しかし、これは装備やスキルで防御力（DEF）が高くなりすぎる数値上の問題が大きい気がします。

同じDEFタイプの前衛でも両手剣のクレイモアと、片手剣と盾のブロードソード＋カイトシールドでは
DEF４、防御すれば８ポイント分の差があります。
レベル１０～２０で前衛の最大ＨＰが３０前後、ポーションが２～７点回復であることを考えると
非常に大きい差です。
両手剣使いが４～８回で戦闘不能になる攻撃を、盾使いは無限に受けて大丈夫なのです。
（そして、後衛が受けたなら一撃で戦闘不能になります）

「攻撃力－防御力」というダメージの出し方だと、防御力１の効果が人間の直感よりかなりデカくなります。
たとえばドラクエだと、防御の数値はダメージ計算時に半分になってたりします。

リアクション「防御」にダイスを導入する、というのはいいと思いますが、
リアクションを使わなくても素でDEFは十分高くなるので
単純に装備品やシールドマスタリーのDEF＋値を下げるのでもいいと思います。
（あるいは両方でも）

なんにせよ、数値が一部だけ高くなりすぎると
「ちょうどいいバランス」を目指せなくなるので、フラットにしてほしいと思います。