短剣採用率が低いのは
・シーフの大きな取り柄だったATKの高さが短剣弱体化で消滅してシーフ自体の人口が激減した。
・ダンサーやアサシンでアタッカーをするなら短剣より片手剣、片手剣より両手剣の方が強い。
という事情があります。
ですので、採用率を気にしているのでしたら今以上に弱くなりそうな案は賛成できません。

シーフ人口については今更短剣の性能を元に戻すのも無理でしょうからスキルの問題が大きいです。
ダンサーやアサシンについては、威力を追求して両手剣型にしている人はどうしようもないですが
「本音を言えばマスタリーが無いので高DEXの短剣型っぽいステにしたいけど短剣が弱すぎて使いたくない」という層が居るでしょう。
ダガーシリーズのATKが+1ずつ強化されてロングソードと並ぶだけで「これだけDEX振っても片手剣持った方が強い」という不満が消えるので採用率は増えると思います。

それ以外の調整案となりますと「クリティカル時に相手DEF半減扱い」「行動順決定の内部ダイス+1d」のようなものを思いつきますが難しそうです。

現状の短剣使いの問題点はSTRとDEXを両方偶数にしないと駄目なのでステ振りが窮屈、しかもそこまでやっても弱いというのが結構大きいです。
以前「STRとDEXが奇数同士なら短剣ATK+1に反映して欲しい」という要望が流れましたが、再調整する際にはこの窮屈な部分を可能でしたら改善して欲しいです。

コメント読み違えていたので再投稿。
面白い提案だと思いますが、更に火力が落ちてしまいそうですね…。
個性付け乃至バランスを取るという意味であれば、
①他の武器にはない特性を与える（Atk以外の補正値を増やす）
②条件付きで片手剣の火力を上回れるようにする（相手のステータスに応じて火力が変わる等）
③種類を増やす（特に両手持ち短剣は現状存在しないため）
といった提案を便乗し提案致します。